ISSN: 1304-7191 | E-ISSN: 1304-7205
Genotyping and Analysis of rs7501939 Polymorphism for Prostate Cancer
1
2
3
4
Sigma J Eng Nat Sci 2015; 6(): 101-107
Full Text PDF (Turkish)

Abstract

Prostate cancer is the second most common cause of death from cancer among men in Turkey. It is known that genetics plays a critical role in prostate cancer susceptibility. Several genome wide association studies reported that rs7501939 polymorphism was significantly associated with prostate cancer. To confirm association of rs7501939 alleles with prostate cancer in our population, genotyping was conducted by using the iPLEX assay in study group which consists of 85 prostate cancer patients and 90 healty controls. In this study, previous reports of rs7501939 variant association with prostate cancer was not confirmed for our population.The odds ratio for prostate cancer was 0,75 (95% CI=0,48-1,18) for carriers of any T allele compared with noncarriers (p=0,211). Chi square and Fisher’s exact test results showed that rs7501939 variant was not statistically associated with clinico-pathological variables of prostate cancer patients in our population.


Prostat Kanseri İçin rs7501939 Polimorfizminin Genotiplenmesi ve Analizi
1Yıldız Teknik Üniversitesi, Kimya Metalurji Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü, Davutpaşa, İSTANBUL
2Bakırköy Dr. Sadi Konuk Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Üroloji Kliniği, İSTANBUL
3Bezmialem Vakıf Üniversitesi, Tıp Fakültesi, İSTANBUL
4Dokuz Eylül Üniversitesi, Onkoloji Enstitüsü, İZMİR
Sigma Journal of Engineering and Natural Sciences 2015; (6): 101-107

Prostat kanseri Türkiye’de erkekler arasında kanserden ölümlerin ikinci en yaygın sebebidir. Prostat kanserine yatkınlıkta genetiğin önemli bir rol oynadığı bilinmektedir. Farklı genom boyu ilişkilendirme çalışmaları rs7501939 polimorfizminin prostat kanseri ile anlamlı bir şekilde ilişkili olduğunu rapor etmiştir. rs7501939 allellerinin bizim toplumumuzda prostat kanseri ile ilişkisini doğrulamak için, iPLEX yöntemi ile 85 prostat kanseri hastası ve 90 sağlıklı kontrolden oluşan çalışma grubunda genotipleme yapılmıştır. Bu çalışmada, rs7501939 polimorfizminin prostat kanseri ile ilişkili olduğuna dair daha önceki raporlar doğrulanmamıştır. Prostat kanseri için T alleli taşıyanlarda bu alleli taşımayanlara göre odds ratio değerinin 0,75 (%95 GA=0,48-1,18) olduğu hesaplanmıştır (p=0,211). Ki kare ve Fisher kesinlik testi sonuçları rs7501939 polimorfizminin toplumumuzdaki prostat kanseri hastalarının kliniko-patolojik değişkenleriyle istatissel olarak ilişkili olmadığını göstermiştir.