ISSN: 1304-7191 | E-ISSN: 1304-7205
The Vibrational Analysis of Pyridoxine and Its H2O Clusters By Ab-Initio Density Functional Method
1
2
Sigma J Eng Nat Sci 2015; 6(): 139-147
Full Text PDF (Turkish)

Abstract

The conformations of pyridoxine were searched by means of torsion potential energy surfaces scan studies through dihedral angles D1 (9H-8O-4C-3C), D2 (12H-10C-5C-6N), D3 (15O-14C-2C-1C) and D4 (O22- 19H-3C-2C). In all calculations, Ab-Initio DFT (Density Functional Theory) method used and 6- 311G++(d,p) basis set has been chosen. The molecular geometries of pyridoxine and pyridoxine-H2O complexes were optimized using DFT method at 6-311++G(d,p) level of theory. The harmonic and anharmonic vibrational wavenumbers, IR and Raman intensities of the most stable monomer was calculated. The results were compared with the experimental data. The assignment of the vibrational modes were determined by using GAR2PED program. HOMO-LUMO energy gap was calculated.


Pridoksin Molekülünün ve H2O Komplekslerinin Ab-Initio DFT Teorisi ile Titreşimsel Analizi
1Yıldız Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Fizik Anabilim Dalı, Yıldız, İSTANBUL
2İstanbul Kültür Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Fizik Bölümü, Ataköy, İSTANBUL
Sigma Journal of Engineering and Natural Sciences 2015; (6): 139-147

Pridoksin molekülünün konformerleri potansiyel enerji yüzey analizi yardımıyla D1 (9H-8O-4C-3C), D2 (12H-10C-5C-6N), D3 (15O-14C-2C-1C) ve D4 (O22-19H-3C-2C) dihedral açıları kullanılarak araştırılmıştır. Hesaplamalarda Ab-Initio yöntemlerinden DFT (Yoğunluk Fonksiyonu Teorisi) kullanılmış ve 6-311G++(d,p) baz seti seçilmiştir. Pridoksin ve pridoksin molekülünün su komplekslerinin moleküler geometrisi DFT yöntemi ve 6-311G++(d,p) baz seti seçilerek optimize edilmiştir. En düşük enerjili konformerinin harmonik ve anharmonik titreşim dalgasayıları, IR ve Raman şiddetleri hesaplanmıştır. Deneysel ve teorik sonuçlar karşılaştırılmıştır. GAR2PED programı kullanılarak titreşim kipleri belirlenmiştir. HOMO-LUMO enerji farkı hesaplanmıştır.